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化學合成法：化學合成法可以通過精心設計基質合成特殊結構的低聚糖。隨著近幾年糖化學的興起，殼寡糖的合成也日益受到研究者的關注。利用幾丁質酶制備殼聚糖和殼聚糖的雜環衍生物，而且還具有生物活性。FridmanMicha等運用一鍋煮的方法制備了殼寡糖三糖和四糖，產率在51%～80%之間。這種方法的優點就是可以根據自己的需要來設計寡糖。2.物理制備法1）超聲波法和微波法：在上世紀80年代末期，我國學者王將甲殼質脫乙酰化后，溶于乙酸溶液中，在60℃條件下用超聲波處理，發現殼聚糖粘度，而降解過程中對氨基的含量沒有影響。微波輻射法近年來也引起了人們的研究興趣，將聚合度為3～150，相對分子量在600～3Chemicalbook0000之間的殼聚糖加入含有NaCl或KCl或CaC12的電解質稀酸溶液中，以480～800W的微波輻射能量，降解反應3～12min，冷卻至室溫，再用2M的NaOH液中和得淡黃色絮狀沉淀；再在4℃冷藏柜中沉淀30min，抽濾，所得濾餅再在60℃下烘干，粉碎，即得甲殼低聚糖化合物。此方法能夠降低能耗，減少污染，節省時間和原料，具有產業化前景和廣泛的市場潛力。2）γ射線照射下輻射降解：輻射降解是在放射性射線照射下，使殼聚糖分子產生電離或激發的物理效應，進而導致分子鏈斷裂。用放射性鈷在大氣和真空下照射相對分子量為2.74×105的殼聚糖，得到一系列低聚合度殼聚糖，而且不但沒有破壞氨基含量，反而含量增加。