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瓊脂由瓊脂糖（Agarose）和瓊脂果膠（Agaropectin）兩部分組成，

作為膠凝劑的瓊脂糖是不含硫酸酯（鹽）的非離子型多糖，是形成凝膠的組分，其大分子鏈鏈節著1，3苷鍵交替相連的β-D-半乳糖殘基和3,6-內醚-L-半乳糖殘基 。而瓊脂果膠是非凝膠部分，是帶有硫酸酯（鹽）、葡萄糖醛酸和丙酮酸醛的復雜多糖，也是商業提取中力圖去掉的部分。商品瓊脂一般帶有2%～7%的硫酸酯（鹽），0%～3%的丙酮酸醛及1%～3%的甲乙基。在工業上的瓊脂 色澤由白到微黃，具有膠質感，無氣味或有輕微的特征性氣味，瓊脂不溶于冷水，易溶于沸水，緩溶于熱水。

瓊脂系選用優質天然石花菜、江蘺菜（ Gracilaria）、紫菜（porphyra）等海藻為原料，采用科學方法精煉提純的天然高分子多糖物質。含有多種元素，并具有、之功能。